Положение в бассейне Уэд-Тафна сделало Магния естественным местом обмена между западом Магриба и внутренними районами. В римскую эпоху здесь существовал Numerus Syrorum - военный пост, который контролировал западный край римской провинциальной сети. После исламизации местность связывали с Лалла Магния, почитаемой праведницей; вокруг её памяти и караванных дорог поддерживались рынки и поселение. Французский военный пост появился в 1844 году, а колониальный центр Marnia оформился в 1871 году и получил муниципальный статус в 1928-м. После независимости закрепилось имя Магния, город быстро вырос как сельскохозяйственный, торговый и пограничный центр. Железнодорожный участок и дороги усилили сообщение с Тлемсеном, но закрытость границы периодически меняла экономический ритм. Сегодня город сохраняет приграничную многослойность: римский топоним, культ местной святой, колониальная планировка и современный рынок сосуществуют без единого парадного ансамбля.