Историческая глубина района Богры связана не с современной городской сеткой, а с Пундрананагаром, чьи остатки известны как Махастхангарх. Государственный департамент археологии датирует существование этого укреплённого города промежутком от IV века до н. э. до XV века н. э.; его руины стоят на западном берегу Каратои. В 1919 году цитадель и сорок окружающих древних холмов были объявлены охраняемыми памятниками. В разные эпохи вокруг неё возникали религиозные и жилые комплексы, связанные с сельской равниной и речными путями. Например, раскопки Гокула Медха в 1934-1936 годах открыли террасное основание святилища или ступы VI-VII веков, позднее перестроенное в храм. Современная Богра развивалась отдельно как административный рынок и дорожный центр северной равнины. В колониальный период сохранился комплекс, известный как Нилкути; сейчас окружной портал связывает его с Наваб-паласом. В современной Бангладеш город усиливал промышленную, банковскую и транспортную функции, тогда как древние объекты получили режим охраняемого наследия. Поэтому сегодняшняя Богра - не продолжение городской ткани Пундрананагара, а удобный современный центр рядом с многослойным археологическим ландшафтом и собственной экономической жизнью.