История Франсистауна начинается с более ранних поселений и торговли в районе рек Тати и Нтсве, однако современный город сформировала золотая лихорадка XIX века. В 1860-е годы в Тати обнаружили золото, и в регион приехали старатели, торговцы и владельцы концессий. Дэниел Фрэнсис получил лицензии на поиски в 1869 году, а компания Tati Concessions стала одним из главных землевладельцев и организаторов добычи. Золотые шахты не создали устойчивого богатства, но закрепили дороги, магазины и многоязычную рабочую среду. Перелом наступил в 1897 году, когда железнодорожная линия Британской Южно-Африканской компании достигла Монарха: рельсы связали рудники с югом и рынками региона. Поселение стало коммерческим узлом, а не только лагерем горняков. В колониальный период развивались железнодорожные кварталы, миссии, школы и административные здания; рядом с ними существовали рабочие районы и места найма на южноафриканские шахты. После независимости Ботсваны в 1966 году Франсистаун сохранил роль регионального центра Северо-Восточного округа. Вторая половина XX века принесла рост торговли, дорог, аэропорта и пригородов, а добыча постепенно уступила место услугам и государственным учреждениям. История города связана и с освободительными движениями юга Африки: через него проходили люди, почта и политические связи между Ботсваной, Зимбабве, Намибией и Южной Африкой. Сегодня музей, названия улиц, железная дорога и сохранившиеся здания помогают увидеть, как золотой промысел превратил речное поселение в современный городской узел.