До колонизации на территории современного муниципалитета жили коренные общины, в том числе народы тупи и тапеба; их присутствие остаётся важной частью местной идентичности и земельных вопросов, а не только фоном для туристического рассказа. В XVII-XVIII веках миссионерская политика преобразовала местное поселение в альдею, позднее известную как Soure. Муниципальная палата Каукаи связывает создание Aldeia de Soure с распоряжениями эпохи маркиза де Помбала, когда иезуитские миссии перестраивались в вилы и приходы. В XIX веке территория развивалась как сельскохозяйственная и торговая зона рядом с Форталезой. В XX столетии связь со столицей усилили дороги, железная дорога и расширение городской агломерации; одновременно побережье сохраняло рыбацкие деревни. Природные лагуны и берег были прежде всего средой повседневного промысла, а уже затем стали частью туристического продукта; местная экономика оставалась зависимой и от сельских территорий. С 1980-х годов Кунбуку и Табуба всё заметнее вошли в туристическую экономику Сеары, а ветровой спорт дал курортной полосе международную известность. Современная Каукая - не единый курортный город, а крупный муниципалитет с городской, промышленной, сельской и прибрежной реальностью.