Первое испанское поселение Консепсьон основал Педро де Вальдивия в 1550 году у нынешнего Пенко, на побережье залива. Из-за землетрясений, цунами и сложных условий старый город неоднократно страдал, а после разрушительного землетрясения 1751 года его перенесли в долину у реки Био-Био, где он находится сегодня. 1 января 1818 года на площади была провозглашена независимость Чили, что закрепило политическую символику центрального пространства. В XIX-XX веках портовые связи, уголь Лоты, металлургия, текстиль и железная дорога превратили регион в промышленный узел. Университет Консепсьона, основанный в 1919 году, добавил городу интеллектуальный и архитектурный центр с кампусом, парками и культурными учреждениями. Землетрясение 1939 года в Чильяне и землетрясение Вальдивия 1960 года вновь повредили регион, а катастрофа 27 февраля 2010 года потребовала масштабной реконструкции набережной и общественных зданий. Сегодня городская идентичность складывается из университетской автономии, музыки, театра, инженерной культуры и памяти о природных катастрофах. В Большом Консепсьоне эти слои продолжаются в портовых, угольных и прибрежных коммунах, связанных транспортом и общей экономикой Био-Био.