Долина Куэнки была заселена народами каньяри, а затем вошла в сферу инков; археологические следы обоих периодов сохраняются в регионе. Испанцы основали город Санта-Ана-де-лос-Риос-де-Куэнка в 1557 году, наложив колониальную сетку на более ранний ландшафт. В колониальную эпоху развивались церковные учреждения, ремесло и торговля между побережьем и высокогорьем. После независимости город стал административным центром Асуая, а республиканская архитектура изменила фасады и общественные площади. Железнодорожные и дорожные связи XX века усилили торговую роль Куэнки, а университеты превратили её в образовательный центр. В 1999 году исторический центр получил статус ЮНЕСКО благодаря непрерывной городской ткани и смешению колониальных и местных традиций. Река Томебамба и район Barranco пережили модернизацию как общественное пространство, а музей Pumapungo связал городскую жизнь с археологией. Сегодня Куэнка сохраняет не только отдельные памятники, но и живую систему рынков, мастерских, храмов и жилых улиц, поэтому её наследие лучше читать пешком.