На территории нынешнего кантона Дюран существовали поселения, использовавшие речные пути для обмена с соседними общинами. Справочник Ассоциации муниципалитетов Эквадора отмечает, что с 1880-х годов у подножия холма Лас-Кабрас стало прибавляться домов, а близость Гуаякиля усиливала торговлю. В октябре 1902 года Дюран получил статус сельского прихода в составе кантона Гуаякиль. В июне 1920 года за ним закрепили имя генерала Элой Альфаро. Железнодорожная связь побережья с внутренними районами страны придала станции особое значение для пассажиров и грузов. Решение о кантонализации было принято в декабре 1985 года и опубликовано в январе 1986 года: так возник отдельный кантон Дюран. Позднее город расширился как жилой и промышленный сосед Гуаякиля. Набережные и ротонда сохраняют память о речном и железнодорожном прошлом, но нынешний режим безопасности не позволяет превращать эту историю в рекомендацию для прогулки.