Письменная история Тарту начинается с упоминания крепости Юрьев в 1030 году; позднее территория переходила между Данией, Ливонским орденом, Польшей, Швецией и Россией. Университет, основанный шведским королём Густавом II Адольфом в 1632 году, сделал город интеллектуальным центром, хотя войны временно прерывали его работу. Пожары 1708, 1763 и 1775 годов уничтожили значительную часть средневековой ткани, после чего Тарту перестраивался в барочном и классическом стилях. В XIX веке здесь усилились эстонское национальное движение, печать и песенная традиция; в 1869 году прошёл первый Эстонский праздник песни. В 1909 году основали Эстонский национальный музей, а 1 декабря 1919 года университет открылся как национальный вуз с эстонским языком преподавания. Советский период изменил городскую экономику, но университетская роль сохранилась; после восстановления независимости Тарту снова стал международным академическим узлом.