Баколод вырос из поселения у устья реки Магсунгай. Городской план землепользования связывает его раннюю историю с прибрежной деревней, которая уже в XVI веке упоминалась среди зависимых поселений соседнего Баго. При испанском правлении община постепенно переместилась от старого берега к нынешнему центру; приход и затем собор Святого Себастьяна стали важными ориентирами городской жизни. В XIX веке Баколод усилился как административный и торговый узел Негроса, экономика которого всё теснее связывалась с выращиванием сахарного тростника. Во время революции 5 ноября 1898 года город оказался в центре событий на острове. Площадь, собор и старые городские кварталы позволяют читать эту историю на месте. 19 октября 1938 года Баколод торжественно вступил в статус города: муниципальный документ напоминает о дереве, посаженном президентом Мануэлем Кесоном на Public Plaza в день инаугурации. Позднее город продолжал развиваться как административный центр и транспортный узел Западного Негроса. Современную культурную жизнь сделали узнаваемой фестиваль Масскара и местная кухня, прежде всего курица инасаль; городской совет отдельно закрепил фестиваль Manokan Country Inasal. При этом знаменитые руины сахарного особняка находятся в соседнем Талисае, и их историю следует относить к окрестностям, а не к городской территории Баколода.