Античный Cabillonum был важным поселением и портом эдуев на Saône, включённым в римскую транспортную сеть. После распада империи город сохранял значение благодаря реке и епископской кафедре. В Средние века он входил в политическое пространство Бургундии, а крупные ярмарки привлекали купцов из разных регионов Европы. Религиозный центр формировался вокруг Saint-Vincent, перестраивавшегося от романского времени к готике. Пограничные конфликты и королевская централизация меняли укрепления, но торговая функция оставалась. В Новое время порт, ремесленные корпорации и водные перевозки поддерживали рост. В 1765 году здесь родился Nicéphore Niépce; позднее в Saint-Loup-de-Varennes он проводил опыты, приведшие к первой устойчивой фотографии. XIX век принёс канализацию Saône, железную дорогу, металлургию, судостроение и машиностроение; компания Schneider развивала местные заводские мощности. Во Вторую мировую войну город и мосты имели стратегическое значение, а жители участвовали в Сопротивлении. После деиндустриализации набережные и центр переосмыслили для культуры и туризма. Musée Niépce стал одним из главных исследовательских музеев фотографии, а фестиваль Chalon dans la Rue закрепил современную репутацию открытого театрального города.