Официальные источники описывают происхождение Гуаймаки по-разному в деталях, но сходятся в ключевых вехах. В 1682 году священник Антонио Навия Боланьос способствовал объединению расселённых жителей долины в поселение Санта-Роса-де-Гуаймака. Ранние группы жили возле Эль-Дестино и Лос-Климас, а затем часть населения оказалась в месте, известном как Pueblo Viejo. Документы также связывают историю территории с ксикаке и толупанами, чьи общины сохраняли отдельную культурную память в горных районах. В первом переписном описании конца XVIII века Гуаймака уже фигурировала как поселение. Муниципальный статус был получен 24 мая 1873 года, а в 1889 году территория входила в округ Седрос под названием Санта-Роса-де-Гуаймака. В августе 1993 года городу присвоили городской титул. Сегодня исторические слои соседствуют с торговлей, земледелием, лесными ресурсами и патрональной ярмаркой 30 августа. Путешественнику следует различать документированные даты, устные рассказы и живое наследие общин, не превращая сложную историю коренных народов в декоративный сюжет.