Муниципалитет Пуэрто-Лемпира получил статус 5 августа 1957 года, а сам город стал столицей департамента Грасьяс-а-Дьос, ранее связанного с Брус-Лагуной как административным центром. Развитие поселения определили водные пути, торговля, рыболовство и необходимость управлять огромной территорией Ла-Москитии. По государственным материалам, около 82% жителей муниципалитета в переписи 2013 года отнесли себя к мискито, что делает культурную автономию и язык важной частью городской идентичности. В XX и XXI веках к традиционному хозяйству добавились службы, снабжение и природоохранные проекты, но удалённость по-прежнему ограничивает дороги, электричество и туристическую инфраструктуру. Административный статус не превратил город в крупный порт: многие товары и пассажиры по-прежнему зависят от лодок и малой авиации. Поэтому история Пуэрто-Лемпиры читается через связь между берегом лагуны, общинами и лесом, а не через монументальную застройку. Уважительное знакомство с регионом требует учитывать колониальные и современные внешние влияния, но не описывать мискито как исчезнувшее прошлое. Важная особенность развития - отсутствие единой сухопутной сети: вода остаётся дорогой, рынком и связью между селениями. Современную историю региона нельзя отделять от решений самих мискитских общин, природоохранных проектов и ограничений, связанных с удалённостью.