Гунунгситоли вырос из прибрежных поселений Ниаса, где морская торговля связывала остров с Суматрой и соседними районами Индийского океана. Местное общество сохраняло собственные языки, обряды, архитектуру и сложную систему деревенских связей. В колониальный период порт и административные учреждения усилили роль поселения как главного узла острова. После независимости город стал муниципальным центром, а дороги и школы связали его с внутренними районами Ниаса. Землетрясение 28 марта 2005 года сильно изменило городскую среду и привело к масштабному восстановлению инфраструктуры; память об этом событии отражена в Tugu Gempa. Сегодня Гунунгситоли сочетает торговые функции, порт, образование и локальный туризм. Музей, городские парки и культурные мероприятия помогают сохранять наследие Ono Niha, тогда как новые дороги сделали южные деревни и пляжи доступнее для самостоятельных путешествий. Восстановление после катастрофы стало частью современной городской идентичности и повлияло на общественные пространства у берега.