Баткенская долина исторически связывала земледельческие оазисы Ферганы с горными пастбищами Памиро-Алая и торговыми путями Средней Азии. Современный Баткен долго оставался сельским поселением, а статус города получил в 2000 году. После приграничных событий 1999-2000 годов было принято решение создать Баткенскую область с центром в Баткене, укрепив административное присутствие и инфраструктуру региона. Город стал местом работы областных служб, образования, торговли и координации сложной дорожной сети. Садоводство, особенно абрикосы, дополняется туризмом к Айгуль-Тоо, Каравшину и Кан-и-Гуту. Эти объекты формируют образ области, но лежат за пределами Баткена и зависят от сезона, разрешений и безопасности. Современный путешественник должен различать городской центр, природные маршруты, приграничные сёла и иностранную территорию, не упрощая их в один маршрут.