Фомбони развивался как прибрежное поселение Мвали, связанное с морскими маршрутами между островами Коморского архипелага и восточным побережьем Африки. В отличие от более старых султанских медин Анжуана, город известен прежде всего административной и портовой ролью, а не крупным ансамблем дворцов. Колониальная эпоха принесла новые формы управления, торговли и миссионерской деятельности, но сельское хозяйство и морская связь остались основой повседневной жизни. После независимости Фомбони стал столицей автономного острова Мвали, а государственные учреждения сосредоточились рядом с рынком и портом. В конце XX и начале XXI века внимание к острову сместилось к охране морской природы, мангров, кораллов и мест обитания морских черепах. Это сформировало новый тип туризма: небольшие лодочные поездки, деревенские гиды и гостевые дома вместо массовых отелей. Сегодня город нужно отделять от всего Мохели: природный парк, Итсамия и Мирингони находятся вне Фомбони и требуют отдельного транспорта. История и экологическая ценность острова лучше раскрываются при уважении к местным правилам, религиозным нормам и ограниченному ритму инфраструктуры.