Пуэрто-Падре возник как портовый пункт северного побережья, а историки относят современное основание городской общины к 1861 году, хотя название бухты встречается на картах XVI века. Порт обслуживал сахарные районы и торговлю, а крепость Сальседо защищала вход в поселение и дорогу к гавани. В XIX-XX веках город пережил борьбу за независимость и политические перемены, после чего сохранил роль муниципального центра. Пляжный пояс Коваррубиас развивался позднее как отдельное туристическое направление. Сегодня память о порте, сахаре, крепости и «синем» образе соединяет городской маршрут с побережьем. Портовая память остаётся заметной в городской топонимике и рассказах жителей, тогда как курортное развитие сосредоточилось на побережье вне центра. Так Пуэрто-Падре сохраняет отдельную идентичность даже внутри туристического муниципалитета. Сочетание крепости, гавани и пляжа требует разных маршрутов и разного темпа посещения.