Поселение у слияния Немана и Няриса выросло вокруг крепости, защищавшей западные рубежи Великого княжества Литовского от Тевтонского ордена. Каменный Каунасский замок впервые упоминается в связи с нападением 1362 года. Магдебургские права и торговля по рекам способствовали развитию города в XV-XVI веках. После разделов Речи Посполитой Каунас вошёл в Российскую империю, получил крепостное кольцо, железную дорогу и новый городской план. В 1919-1939 годах, когда Вильнюс находился вне Литовской Республики, Каунас выполнял функции временной столицы. За два десятилетия появились министерства, банки, школы, доходные дома и церкви в модернистском стиле. Нацистская оккупация уничтожила большую часть еврейской общины; Каунасское гетто и Девятый форт стали местами массовых убийств. Советская эпоха принесла промышленный рост и новые районы, но ограничила независимую культурную жизнь. Восстановление государственности в 1990 году вернуло городу европейские связи. Статус Европейской столицы культуры 2022 года и включение модернизма в список ЮНЕСКО в 2023 году закрепили новое внимание к архитектурному наследию.