Укрепление Мемельбург у устья Данге основал Ливонский орден в 1252 году, и рядом развился торговый город Мемель. На протяжении веков он принадлежал Пруссии и германским государствам, переживал пожары, войны и конкуренцию балтийских портов. Регулярная сетка старого центра и фахверковые склады отражают североевропейскую строительную традицию. После Первой мировой войны Мемельский край управлялся державами Антанты, а в 1923 году был присоединён к Литве с автономным статусом. В марте 1939 года нацистская Германия аннексировала регион; во время Второй мировой войны еврейская община была уничтожена, население эвакуировалось, а город сильно пострадал. В 1945 году Клайпеда вошла в Литовскую ССР, где порт и промышленность расширялись, а демографический состав резко изменился. После восстановления независимости в 1990 году порт сохранил экономическое значение, исторический центр начал активнее реставрироваться. Куршская коса, часть которой относится к Клайпеде, получила статус Всемирного наследия ЮНЕСКО в 2000 году как уязвимый культурный ландшафт, созданный взаимодействием природы и человека.