Банамба была основана народом марка из Соколо в 1840-х годах и долго оставалась небольшим поселением на нестабильной границе между государствами Бамана и Каарта. В XIX веке расширение империи Тукулёров изменило сухопутные потоки, и город стал важным пунктом оси между Сегу и Ньоро. К концу 1870-х здесь концентрировалась торговля, включая зерно и рабовладельческие практики того времени. В 1905 году через Банамбу прошёл массовый исход порабощённых людей после колониального запрета рабства, что стало важным эпизодом истории западного Судана. Французская администрация закрепила округ и дороги, а после независимости город сохранил роль местного центра. Сегодня рынок и коммунальные службы продолжают старую функцию посредника между сельскими производителями и более крупными городами, но прежняя торговая география не превращает Банамбу в музей под открытым небом.