История Нионо тесно связана с проектом Office du Niger, созданным в колониальный период для управления водами Нигера и развития орошаемого земледелия. После независимости система перешла под управление государства и стала опорой рисоводства, сезонных овощных культур и других производств. Каналы сформировали планировку поселений, дороги и распределение труда вокруг воды. Большая мечеть строилась с 1948 года и расширялась в 1950-е; её создавала бригада мастеров из Дженне, используя сырцовую глину, дерево и глиняный раствор. В 1983 году здание получило архитектурную премию Aga Khan, а позднее было внесено Мали в предварительный список ЮНЕСКО. Нионо оставался центром производственных зон, включая N’Débougou, Молоду и Курумари. Сегодня аграрная инфраструктура зависит от ремонта каналов, уровня воды и безопасности дорог.