До прихода испанцев территория была связана с политическим и ремесленным центром Тонала; местные общины обрабатывали глину и торговали по западной Мексике. В 1530 году войска Нуньо де Гусмана подчинили область, а колониальная администрация и францисканская миссия изменили устройство поселения. Сан-Педро сформировался вокруг храмов, садов и мастерских. В XIX веке конфликты независимости и Реформы затронули дорогу к Гвадалахаре, но керамическое производство сохранилось. Мастер Панталеон Пандуро, родившийся в 1847 году, прославил реалистичные глиняные портреты и укрепил художественную репутацию города. В XX веке рост Гвадалахары поглотил сельские промежутки, превратив Тлакепаке в часть мегаполиса. Культурный центр Эль-Рефухио занял бывший госпитальный комплекс, а музеи систематизировали ремесленное наследие. В 2018 году исторический центр получил федеральный статус Pueblo Mágico. Современные мастерские продолжают работать рядом с музеями, сохраняя ремесло частью повседневной экономики.