Поселение у Нидельвы существовало задолго до того, как король Олав Трюггвасон основал Нидарос около 997 года. После смерти святого Олава в 1030 году город стал главным паломническим центром Норвегии, а Нидаросский собор постепенно превратился в крупнейший готический храм страны. В средние века здесь находилась архиепископская кафедра и королевская власть, затем административный центр сместился к югу. Пожары неоднократно разрушали деревянные кварталы, но Баккландет и складские фасады у реки сохранили исторический масштаб. В XIX-XX веках порт, железная дорога и промышленность связали Тронхейм с центральными районами страны. После создания NTNU город стал заметным образовательным и технологическим узлом. Сегодня паломнический маршрут, университетская экономика и фьордовая торговля существуют в одном компактном центре. Такое соседство объясняет, почему в Тронхейме средневековые здания и исследовательские кампусы воспринимаются как единый городской ландшафт.