Музаффаргарх возник в 1794 году при навабе Музаффар-хане, который создал здесь поселение и укрепление. От его имени закрепилось название города. В 1861 году территория получила оформление отдельного округа в британской административной системе. Положение между Индом и Ченабом стало основой для ирригации и сельского хозяйства, а дороги связали окружной центр с соседними городами. В то же время междуречье уязвимо к сезонным паводкам. Наводнения 2010 года затронули район и инфраструктуру, напомнив, что реки здесь не просто живописный фон. Современный Музаффаргарх выполняет административные и торговые функции округа. Историческое укрепление связано с основанием, однако нынешний городской маршрут не зависит от предположений о свободном входе в его остатки. Мултан остаётся самостоятельным городом на другом берегу и другой транспортной связке.