Арегуа сформировалась на месте коренных поселений у озера Ипакарай и в колониальную эпоху развивалась под влиянием миссий и хозяйственных владений. Традиция связывает раннее основание поселения с 1538 годом, а церковная история восходит к мерседарскому ораторию, существовавшему до нынешнего храма. В XIX веке город получил административное оформление и стал летним местом для писателей, художников и состоятельных жителей Асунсьона. В 1862 году до Арегуа дошла железная дорога, что ускорило перевозку людей, товаров и ремесленных изделий. Керамическое производство постепенно стало главным занятием многих семей; глина превратилась в фигурки, посуду, рождественские композиции и декоративные панно. В XX веке город сохранял связь с озером и столицей, а мастерские поддерживали локальную экономику. Закон 1181 1997 года объявил исторический центр Арегуа национальным культурным наследием и отдельно включил железнодорожную станцию, Castillo Carlota Palmerola и vivienda Facetti. В 2018 году Secretaría Nacional de Cultura расширила охраняемую зону, чтобы сохранить масштаб улиц, фасады и холмистый силуэт. Международное признание усилилось после включения Арегуа в сеть творческих городов UNESCO в категории ремесла и народного искусства. Сегодня город живёт современной торговлей, керамической ярмаркой, клубничным хозяйством и заботой о наследии. Церковь Канделарии остаётся религиозным ориентиром, а Cerro Koi напоминает, что природный и культурный ландшафт здесь неразделим. Посетителю стоит воспринимать Арегуа как действующий город, где традиция продолжается в домах и мастерских.