До колониального поселения земли нынешнего Уараля были частью населённой и возделываемой долины Чанкай. Муниципальная историческая справка упоминает местные общины и название Гуараль-Вьехо. Испанское поселение Сан-Хуан-Баутиста-де-Уараль относят к 1551 году. Долина с доступной водой и плодородными участками поддерживала сельское хозяйство, поэтому город развивался не как морской порт, а как внутренний центр земледельческого района. В республиканскую эпоху Уараль долго был связан с Чанкаем административно. 31 октября 1890 года он получил статус отдельного округа. Следующий важный этап - закон 11 мая 1976 года, создавший провинцию Уараль и сделавший город её центром. Развитие орошения и торговли сельской продукцией укрепило эту роль. Сегодня городская кухня, в том числе «чанчо аль пало», стала видимым культурным продолжением хозяйственной истории долины. Портовый Чанкай и высокогорные поселения остаются частями провинции, но не частями городского Уараля.