Модра имеет многослойную историю, которую туристический портал города оценивает примерно в тринадцать веков. Археологически подтверждено славянское поселение IX века, а первая письменная запись о деревне villa Modor относится к 1256 году. После включения в Венгерское королевство поселение зависело от Братиславского замка, затем принадлежало разным знатным родам. В XIV веке Модра стала городом венгерских королев, а немецкие переселенцы повлияли на право, торговлю и ремесла. В XVI веке город получил статус свободного города, а в начале XVII века - привилегии свободного королевского города. Виноградники существовали давно, однако интенсивная торговля вином особенно выросла после татарского нашествия и прихода немецких колонистов. Модра продавала вино в Моравию, Силезию и южную Австрию; в 1569 году король Максимилиан II закрепил город в королевском владении. Вместе с вином развивались лесное хозяйство, мельницы и многочисленные ремесленные цехи. Гончарный цех основан в 1636 году, а в 1883 году появилась государственная гончарная мастерская. В 1952 году началась история коллектива Slovenská ľudová majolica, превратившего модранскую керамику в национальный бренд. В XVII-XVIII веках школы и евангелическая гимназия укрепили образовательную роль города, а леса заселяли немецкие лесные рабочие, известные как Huncokári. Модра стала важным местом современной словацкой истории благодаря Людовиту Штуру, умершему здесь в 1856 году. В XIX-XX веках появились винодельческая школа и культурные общества. Сегодня сохранённый центр, мастерские, винные события и Малые Карпаты поддерживают городскую идентичность, соединяющую ремесло, язык, вино и лесной ландшафт.