Рогунская территория имеет более древнюю историю, чем современный город: названия Камари Мугул и Калаи Кофар, а также найденные орудия указывают на давнее освоение долины. Современное формирование города связано с советским периодом и началом строительства крупной Рогунской ГЭС в 1976 году. 25 декабря 1986 года здесь организовали городок строителей Рогун, в состав которого вошёл посёлок Обигарм. Первоначальный административный центр связывали с Обигармом, затем его перенесли в новый Рогун, построенный на месте села Майдон. Так возникла особая структура города: старые сельские и санаторные территории соседствуют с планировкой строителей, инженерными объектами и новыми общественными зданиями. После распада СССР проект ГЭС переживал периоды остановки и возобновления, а в 2010-е годы получил новый государственный импульс. В 2018 году прежний Рогун District был объединён с городом, что расширило муниципальную территорию и включило несколько джамоатов. В 2018 году на станции состоялось торжественное включение первого гидроагрегата, а последующее строительство продолжило менять дороги, берега и расселение долины. Параллельно власти сформировали туристическую зону Рогун и программу развития на 2024-2028 годы: в ней перечислены музей, природные ландшафты, источники, санатории и водохранилище как будущие или развиваемые точки посещения. Современная история Рогуна поэтому неотделима от энергетики, переселений, строительства и управления горной территорией. Путешественнику важно разделять городской музей и общественные места от режимной зоны ГЭС, не выдавая проектные планы за уже доступные туристические услуги.