Магун вырос как гавань архипелага Пэнху на пути морских судов через Тайваньский пролив. Рыбаки из Фуцзяни принесли сюда культ морской богини Мацзу и основали храм Тяньхоу, который туристическая администрация Тайваня датирует 1604 годом. Название города связано с храмом Мацзу. Каменная плита у храма напоминает об эпизоде начала XVII века, когда минский военачальник требовал ухода голландских кораблей. Позднее порт оказался в центре столкновений эпохи Мин и Цин; колодец Ваньцзюнь и храм Шигун сохраняют память о морских сражениях. Центральная улица была ранней торговой улицей Магуна; её четырёхглазый колодец обеспечивал водой жителей и моряков. В конце цинского периода возвели городские укрепления и ворота Шуньчэн, часть которых дошла до наших дней. Храм Гуаньиньтин и прибрежная зона стали другим религиозным и общественным пространством. В японский и послевоенный периоды гавань и городская застройка продолжали меняться, но старые храм, улица и стены сохраняли местную память. Для изучения повседневного островного быта в 2010 году открыли Музей жизни Пэнху. Его экспозиции рассказывают о рыбных ловушках, сушке рыбы, домах и праздниках. Аэропорт Пэнху находится в соседнем Хуси, а морские поездки на Цимэй и другие острова сохраняют зависимость от погоды. Поэтому история Магуна читается прежде всего через гавань и храмовый центр.