До прихода переселенцев место нынешнего Тоуфэня населяли общины коренных народов, о которых напоминает старое название одного из кварталов. Городская администрация связывает начало ханьского освоения с 1739 годом: выходец из Цюаньчжоу Линь Эр-шунь и несколько десятков переселенцев договорились о земледелии с местными общинами. Позднее они заложили поселения Фаньпо и Цзинпу и устроили ирригационный канал Лунъэнь. К середине XVIII века появились деревни у нынешней границы Тоуфэня и Чжунаня. В новых поселениях возводили храмовые здания, в том числе храм Трёх горных владык в Доу-хуань-пин, основанный в начале XIX века. Река Чжунган проходит через городскую территорию и объясняет старое сельскохозяйственное освоение равнины. В XIX и XX веках административные границы менялись несколько раз: местность относилась к управлениям Чжуцянь, затем японской префектуре Синьчжу. В 1920 году образовали посёлок Тоуфэнь в округе Чжунань; в 1939 году его повысили до городского посёлка. После реформы 1950 года Тоуфэнь вошёл в новый уезд Мяоли. В 2015 году при населении более ста тысяч прежний посёлок получил статус города уезда. Музыкальный парк, открытый в 2022 году, стал новым общественным пространством для семей. Холмистый «Задний сад» и чайные хозяйства напоминают, что городской рост не уничтожил сельские окрестности.