В 1905 году французский лейтенант Прево создал в Мбаики военный пост, который контролировал дороги и лесные ресурсы Лобае. По Марокко-Конголезскому соглашению 1911 года город был передан Германии и включён в колонию Ной-Камерун. В августе 1914 года французские войска вернули Мбаики, после чего он снова оказался в системе Французской Экваториальной Африки. В 1919 году город стал центром округа Лобае, а в 1925-м спиритане основали католическую миссию Святой Жанны д’Арк. Административные границы менялись: Мбаики переходил между округами Нижнего Убанги, Верхней Санги и Убанги-Шари, пока не закрепился как префектурный центр. После независимости он сохранил роль узла RN6 и рынка кофе, древесины и сельскохозяйственных продуктов. Электричество появилось в 1969 году, а в 1995 году была учреждена римско-католическая епархия. Город и Лобае связаны с историей ака и лесных сообществ, однако их культура не является публичным спектаклем для приезжего. Конфликт 2012 года и последующие кризисы нарушили торговые и общественные связи, особенно для перемещённых и религиозных групп. Сегодня Мбаики сочетает колониальный административный слой, миссию, кофейные хозяйства и лесной ландшафт. Историю города лучше рассказывать через эти связи и помнить, что слабая инфраструктура помощи делает самостоятельный туризм неразумным.