Официальный муниципальный сайт относит начало Энтеббе как административного поселения к 1893 году, когда на полуострове появился гарнизонный пост. В колониальный период здесь работали британские административные учреждения Уганды; город сохранял роль административного центра до 1958 года. Эта история объясняет присутствие государственных зданий, но не означает свободного доступа к ним сегодня. В 1898 году были заложены ботанические сады Энтеббе - один из самых узнаваемых сохранившихся ландшафтных объектов города. Позднее развитие авиации изменило его роль: международный аэропорт сделал полуостров главным воздушным входом в страну и связал Энтеббе с Кампалой ежедневным потоком транспорта. В городской среде появились также научные учреждения, в том числе ветеринарная лаборатория и институт исследования вирусов, которые муниципалитет упоминает среди характерных объектов. Экологический образовательный центр UWEC стал важной общественной площадкой для знакомства с дикой природой Уганды. В 2024 году правительство передало управление ботаническими садами туристическому ведомству; после объединения UWEC с Uganda Wildlife Authority власти сообщали о включении садов в её ведение. Таким образом, нынешний Энтеббе сочетает колониальное административное наследие, авиационный транспорт и охрану природы на берегу Виктории.