Хоима выросла в земле королевства Буньоро-Китара, культурного и политического центра народа баньоро. В XIX веке омюкама Чва II Кабалега укреплял хозяйство и торговлю королевства и сопротивлялся британскому завоеванию; в 1899 году его захватили и отправили в ссылку на Сейшелы. Колониальное управление изменило устройство Буньоро, а Хоима сохранила роль административного и торгового узла западного региона. Традиционные королевства Уганды были упразднены в 1967 году; институт омюкамы восстановили в 1993-м, и дворец Карузиика вновь стал важным символом местной культуры. С начала XXI века разведка обнаружила нефтяные месторождения у озера Альберт, в округе Хоима и соседней Булисе. Город стал сервисным центром для новых региональных проектов, хотя месторождения, планируемый нефтеперерабатывающий объект и аэропорт Кабаале находятся вне его улиц. Так в истории Хоимы соединяются королевская резиденция, колониальные перемены и современное экономическое расширение.