До современного освоения район Томакомая был частью прибрежного мира айнов и лесистой равнины Юфуцу. В эпоху Мэйдзи сюда пришли переселенцы и инфраструктура колонизационной администрации, а реки и портовые бухты стали основой снабжения. Лес, уголь и бумажное производство определили промышленный рост города; компания Oji Paper создала здесь крупное производство и собственную инфраструктуру. Железная дорога связала Томакомай с внутренним Хоккайдо и портами, а в 1963 году открылся современный Томакомайский порт как крупный искусственный портовый комплекс. Паромные линии превратили город в морские ворота между Хоккайдо и Хонсю, а промышленные площадки расширили берег. Одновременно озеро Утонаи стало центром природоохранной работы: в 1981 году здесь появился первый в Японии птичий заповедник Общества диких птиц, в 1982 году территория получила статус национального охраняемого района, а в 1991 году была включена в список Рамсарских угодий. Вулкан Тарумаэ и его лавовый купол сформировали другой слой городской идентичности - геологический и рекреационный. После послевоенной индустриализации Томакомай развивал жилые районы, дороги и связь с Новым Титосэ. Сегодня порт, бумажная промышленность, паромы и охрана водно-болотных угодий существуют рядом. Путешественнику важно воспринимать Томакомай не как курортный город, а как рабочий порт с доступом к редкой природе и вулканическим маршрутам.